Po odhalení záhady devátého chevronu Hvězdné brány se tým průzkumníků vydává na loď bez posádky jménem Destiny, kterou na vrcholu své civilizace vypustili Antikové. Spustili tak velký experiment, který nebyl nikdy dokončen. Prostý průzkum se mění v nekonečnou misi, jakmile si posádka ve Stargate Universe uvědomí, že z lodi není možnost návratu na Zemi a že se musí na palubě lodi postarat sama o sebe.